丰田C-HR它配备的是双区自动空调系统，还带有负离子发生器，空调系统的控制按键行程比较短，按压感比较的生硬，布局比较简洁，其中按键区域造型和方向盘上的一致，采用了菱形风格设计，并结合了钢琴烤漆材质。

根据官方的介绍，CHR的空调系统搭载了丰田独有且最新开发的蓄冷发生器，在发动机自动启停系统开启的时候，怠速熄火时，空调系统仍能持续释放超过60秒的冷风，另外，该空调系统还配备了智能双循环同步制热功能。